Перечень методик/методов

Перечень имеющихся методик/методов ЦКП «Протеомный анализ»

  • Проведение препаративной изоэлектрофокусировки белков по pI в растворе малых объемов (2,5 мл).
  • Разделение белков по их изоэлектрическим параметрам в геле для стрипов и стеклянных трубочек различной длины и диапозонов рН.
  • Проведение вертикального электрофореза малого и большого размеров для разделения белков по массе, позволяющего одновременно работать с количеством гелей до 12 штук, в том числе в гелях с  градиентным распределением плотности.
  • Иммуноблот анализ с использованием специфичных антител.
  • Окрашивания гелей и мембран с использованием колориметрических, флюоресцентных, хемилюминисцентных красителей.
  • Регистрация цветного, флюоресцентного и хемилюменисцентного изображения с последующими обработкой и анализом одно- и двумерных гелей и мембран, в том числе для получения двумерной «белковой» карты».
  • Вырезания белковых бандов или точек из одно- и двумерных гелей и блотов и подготовки образцов для последующего масс-спектрометрического анализа белков.
  • Электрофоретическое разделение нуклеиновых кислот в агарозном и акриламидном гелях.
  • Физико-химическое разделение веществ: повседневная обработка образцов, центрифугирование, экстракция, очистка, концентрирование, разделение фаз, быстрое осаждение белка, крупных частиц, обрывков клеток; приготовление субклеточных органелл, таких как митохондрии, ядра, незрелые микросомы; разделение клеток крови и клеточных компонентов; осаждение нуклеиновой кислоты; градиентное разделение.
  • Хромато-масс-спектрометрический анализ пептидов.
  • Таргетное секвенирование ДНК.
  • Анализ экспрессии генов методом полимеразной цепной реакции (ПЦР-анализ).
  • Аллель-специфичная ПЦР.
  • Анализ методом ПЦР в режиме реального времени.
  • Высокоэффективная жидкостная хроматография с возможностью спектрофотометрической (UV/Vis), флуоресцентной и электрохимической детекции.
  • Лазерная микродиссекция препаратов из образцов замороженных и фиксированных тканей с использованием традиционных микроскопических методов: светлое поле, темное поле, освещение поляризованным светом, фазовый контраст и флуоресценция.
  • Изоляция лазерным микродиссектором клонов и клеток определенного типа с последующим культивированием, изучение взаимодействия клеток в культуре.
  • Иммуногистохимический анализ.
  • Оценка токсичности химических соединений методом двойного окрашивания клеток препаратами хехст и пропидиум иодид с последующим подсчетом процента живых метрвых и апоптотических клеток.
  • Изучение клеточной жизнеспособности и пролиферации.
  • Детекция клеток в реальном времени: анализ клеточной адгезии и миграции.
  • Получение и анализ изображений клеток в светлом поле.
  • Анализ локализации и распределения флуоресцентно-меченых белков на фиксированных препаратах тканевых срезов.
  • Оценка токсичности перитонеальных макрофагов мыши методом окрашивания аннексином и пропидиум иодидом.
  • Анализ локализации и распределения флуоресцентно-меченых белков в живых клетках.
  • Оценка образования в клетках активных форм кислорода с использованием DCF в реальном времени.
  • Исследование проникновения и выведения флюоресцентных препаратов в клетку в реальном времени.
  • Синтез олигонуклеотидов.
  • Проведение капельной цифровой ПЦР.